Інститут підвищення кваліфікації керівних працівників і спеціалістів з філіалами у містах Вінниці та Одесі був створений у 1969 р. згідно з наказом Міністерства харчової промисловості УРСР від 25.08.69 №339 на виконання Постанови Ради Міністрів УРСР від 08.08.69 №472.

Інститут післядипломної освіти створено в результаті реорганізації колишнього Інституту підвищення кваліфікації і перепідготовки керівних працівників і спеціалістів харчової і переробної промисловості Держпроду та інтегровано до Національного університету харчових технологій (НУХТ).

Понад 30 років Інститут успішно виконував покладені на нього функції як заклад післядипломної освіти при галузевому міністерстві. Разом з тим, сучасний досвід країн з розвиненою ринковою економікою свідчить, що післядипломна освіта є найбільш ефективною у разі, якщо вона зосереджується на базі провідних національних освітніх закладів — університетів.

Саме такий підхід втілений у розпорядженні Кабінету Міністрів України від 3 листопада 2000 року № 436-р про передачу Інституту до сфери управління Міністерства освіти і науки. Наступним кроком стало приєднання ІПК до Національного університету харчових технологій, що означає формування завершеної системи кадрового забезпечення галузей харчової та переробної промисловості.

Здійснена реорганізація не передбачає радикальних змін у стосунках Інституту із замовниками навчання. Інститут, як і у попередні роки, має частку бюджетного фінансування, як навчальний заклад післядипломної освіти кадрів АПК. Згідно з чинним порядком, встановленим Кабміном, заявки підприємств і об’єднань, своєчасно включені до плану перепідготовки і підвищення кваліфікації, і надалі фінансуватимуться з державного бюджету.

На відзнаку 35-річчя провадження освітянської діяльності за вагомий внесок у підготовку висококваліфікованих спеціалістів, високий професіоналізм колектив Інституту післядипломної освіти НУХТ нагороджено Почесною грамотою Кабінету Міністрів України (Постанова Кабінету Міністрів України від 7 вересня 2004 р. № 1157).

Концентрація досвіду, накопиченого науково-педагогічними працівниками Інституту протягом багаторічної співпраці із сотнями підприємств, щодо впровадження передових технологій виробничниками України, сприяє розв'язанню більшості задач, які постають перед спеціалістами харчової промисловості в умовах сьогодення.